男子スプリントに今大会出場したのは日本人7人を含む計21人。日本からは、この種目で東京オリンピック日本代表の新田祐大と脇本雄太、そして日本タイトルホールダーでもあり世界トップのスプリンターの地位を築いている深谷知広、今大会がUCIの国際大会に初出場となる山﨑賢人に加え、松井宏佑、新山響平、中野慎詞もエントリー。

予選、1回戦、2回戦を経て準決勝に進出したのはすべて日本人選手（脇本、松井、新田、深谷）。決勝はオリンピック日本代表の脇本と新田の戦いとなった。

決勝：脇本雄太vs新田祐大

1本目、新田が前、脇本が後ろで静かにお互いを見ながら進むレース。互いがプレッシャーをかけあうように少しずつスピードが上がりながら残り1周。新田が第2コーナーを抜け、バンク上部から一気に加速すると、後ろから続いて脇本が仕掛ける。最終コーナーを抜けるとほぼ横並びとなった両者だが、最後は内側の新田が車輪一つほど前でフィニッシュ。1本目は新田が獲得した。

2本目、脇本が前、新田が後ろとなり始まった決勝2本目。新田が脇本にプレッシャーをかけながら、残り1周半で内側から前に出ようとするも、進路を脇本が阻む。位置関係が変わらず残り1周を切り、両者はスプリント体制へ。

残り半周となり外から脇本に並びかけた新田。脇本と新田で並走となって勝負は最終ストレートへ。内に脇本、外に新田となったレースは最後に新田が車輪一つ抜け出し先着。

この結果、新田が脇本をストレートで下し、自身初、日本史上初、大会史上初（名称変更してから初めての大会なので）の男子スプリント金メダル獲得を果たした。

短距離ヘッドコーチ ブノワ・ベトゥ氏は「新田の戦略や走りを見ると、東京オリンピックではケイリンを第一に考え、スプリント種目を視野に入れていなかったが、スプリントでもメダルの可能性があるように感じる」とコメントした。

2021年5月14日（金）香港行われた『TISSOT UCIネーションズカップ』第2戦の2日目、女子スプリントで小林優香が銀メダル、梅川風子が銅メダルを獲得した。2〜5位を日本人選手が独占する結果となった。優勝は女子スプリント界の強豪、香港のリー・ワイジー（李慧詩）。

決勝：小林優香vsリー・ワイジー（李慧詩）

1本目、小林が前、リーが後ろの位置でスタート。残り1周を迎え、共にフィニッシュラインへ向けて加速する。残り半周で小林はリーに並びかけられるが、小林もここで粘る。最終コーナーを抜けても若干リードを保つが、リー・ワイジーのスピードは更に伸び、リー・ワイジーが先着した。

2本目は小林が後ろ、リーが前でのスタート。大きく車間を空けゆっくりと進むが、小林が大きく車体をゆさぶり隙きを突いて前へ。しかしリーは直後から小林の後ろへつけ、小林がペースアップをしてもピタリとついていく。残り半周、リーが小林へ並びかけ、最終コーナーで抜き去るとそのままフィニッシュ。リーの優勝が決まった。

小林はレース後に「リー・ワイジー選手とスプリントで対戦をするのは3回目でしたが、今回は自分の力を出し切る事も出来たし、2本目が1本目を走り終えてから5分も無い中での出走でしたが、それでも戦う事が出来たので（東京オリンピック）本番へ向けて良い材料になりました。彼女に勝つ事が、他の外国人選手を相手にも戦えるという事でもあるので、今回のレースをしっかりと振り返りたいなと思います」とコメントした。